U skladu sa Statutom Državnog arhiva u Pazinu i Pravilnikom o unutarnjem ustrojstvu, radnim mjestima i načinu rada, Državni arhiv u Pazinu ustrojen je u dvije osnovne ustrojbene jedinice:
- Ravnateljica
- Odjel za upravljanje gradivom u arhivu i izvan arhiva
- Odjel za opće poslove i korištenje gradiva